Получен ответ от технической поддержки Яндекса:
Приношу свои глубочайшие извинения за столь длительную задержку с ответом.
В настоящий момент с Вашим сайтом все в порядке, он прошёл перепроверку и не помечен как угрожающий безопасности компьютера.
С уважением, Платон Щукин
Служба поддержки Яндекса